인근 지역 아파트들과의 이해 상충도 예상된다. 입주민이 아닌 이상 아파트 건물은 물론 단지 내 상가 등에도 출입 자체가 봉쇄되는 만큼, 이웃에게는 베푸는 것 없이 도로 등 지역 기반시설의 질만 떨어뜨리기 때문이다.
주상복합은 높은 용적률로 인해 주거환경의 쾌적성이 떨어지게 마련이다. 도심에 위치한 만큼 교통의 편리성에 반해 소음이나 방범 등 문제에서 자유롭지 않다. 무엇보다도 일반 아파트의 2~4배에 달하는 높은 관리비가 상당히 부담될 수 있다.
전용률이 낮고 발코니 등의 서비스 면적이 거의 없어 좁아 보이며, 창문을 열 수 없거나 열리더라도 좁게 열려 환기가 좋지 못하다. 통풍이나 쾌적성 측면에서 일반아파트에 떨어지게 마련이고, 지진이나 화재 등 비상 사태에 대한 대비도 문제점으로 지적되고 있다.